Awalnya disebut Mangostana Garcinia Gaertner, termasuk dalam famili Guttiferae yang mencakup 35 genera dan lebih dari 800 spesies asli daerah tropis. Diantaranya terdapat 9 genera pohon buah-buahan. Lima genera dengan sekitar 50 spesies dalam famili ini berasal dari Asia Tenggara. Garcinia dianggap sebagai jenis genus keluarga ini, yang juga mencakup Mammea. Mammea adalah genus penting secara ekonomi yang dikenal sebagai Mammy Apple atau Mammy, M. Amerika. Menurut Cox (1976), genus Garcinia merupakan genus terbesar (lebih dari 400 spesies), memiliki 40 spesies yang dapat dimakan dan banyak ditemukan di pulau Kalimantan.
Di Asia Tenggara, manggis dikenal dengan banyak nama, seperti Manggis di Indonesia dan Malaysia, kadang disebut setor, mesetor atau semehut di Malaysia, manggustan atau manggis di Filipina, mongkhul di Kamboja, mangkhud di Laos, dodol atau mangkhut di Thailand dan potongan mang pedas di Vietnam , mangustai dalam bahasa Tamil. Di Perancis disebut mangostanaier, luwak atau manggis, di Spanyol disebut mangostan, di Jerman mangostane, di Belanda disebut mangoestan atau manggis, sedangkan di Portugal disebut mangosta atau mangusta.
Manggis adalah salah satu pohon buah-buahan tropis yang pertumbuhannya paling lambat namun juga berumur paling panjang. Pohon yang ditanam dari biji biasanya membutuhkan waktu 10 hingga 15 tahun untuk mulai menghasilkan buah. Tingginya 10 hingga 25 meter dengan kanopi berukuran sedang dan kanopi piramidal yang teduh. Diameter batang 25 sampai 35 cm, kulit kayu biasanya berwarna coklat tua atau hampir hitam, kasar dan mudah terkelupas. Getah manggis kuning (getah kuning) atau resin terdapat di seluruh jaringan utama tanaman.
Sistem perakaran manggis rapuh, tumbuh lambat, dan mudah terganggu akibat tidak adanya bulu akar pada akar utama dan sekunder. Bukti ini memberikan indikasi yang jelas bahwa akar pada awalnya mempunyai sifat yang sama dengan akar dari biji yang ditanam di air, namun kurang berfungsi jika ditanam di media pot yang padat.
Daunnya letaknya saling berhadapan, daunnya sederhana dengan tangkai daun pendek menyambung ke pucuk, panjang tangkai daun 1,5 - 2 cm, bilahnya lonjong, elips atau elips dengan panjang 15 cm hingga 2 cm. 2 cm. Lebar 25 cm x 7 - 13 cm, mengkilat, tebal dan keras, ujung daun meruncing (pinang) dan licin (halus).
Daun dapat bertahan selama beberapa tahun dengan daun baru di sebagian besar cabang dihasilkan dari pertumbuhan baru yang muncul sekali atau dua kali setahun. Daun baru berwarna merah muda dan mungkin berubah menjadi hijau cerah, namun perubahan warna ini hanya berlangsung singkat dan dengan cepat berubah menjadi hijau tua saat daun matang.
Bunga bersifat berumah satu (biologis), namun hanya bunga betina yang dapat berbunga Sedangkan bunga jantan belum berkembang sempurna (rudimenter), artinya menjadi kecil, kemudian kering dan tidak dapat berfungsi terdapat pada ujung cabang muda yang berdiameter 5 – 6 cm. Tangkai bunganya pendek, tebal, panjang 1,8 - 2 cm, terletak di pangkal bunga, dengan 4 sepal dan 4 kelopak. Tangkai bunga pendek, tebal, berwarna kuning-merah. dan kelopak bunganya langsung rontok setelahnya.
Buah manggis dihasilkan melalui partenogenesis (tanpa penyerbukan). Buah partenokarpik biasanya berbentuk bulat, daging buah lunak ketika hampir matang, pipih pada pangkal, kelopak tebal dan rongga putik pada bagian bawah, sisa rongga putik masih tersisa pada ujung buah. Buahnya berbentuk bulat atau agak pipih dan relatif kecil dengan diameter 3,5 sampai 8 cm. Berat buah bervariasi dari 75 hingga 150 g tergantung umur pohon dan wilayah geografis. Kulit buahnya mengandung resin berwarna kuning dan memiliki rasa yang pahit.
Jika buah muda terluka, getah kuning akan menetes. Kulitnya setebal 0,8 sampai 1 cm, berwarna ungu, sering kali mengandung cairan kuning pahit. Kulitnya mengandung tanin dan senyawa kristal yang disebut manggis. Pada buah matang, struktur kulit yang keras memberikan perlindungan yang sangat baik untuk daging yang lembut dan dapat dimakan serta memudahkan pengemasan dan transportasi.